本發(fā)明屬于分子生物學(xué)和蛋白質(zhì)工程改造領(lǐng)域,具體涉及一種新型的sephchc合酶突變體蛋白。
背景技術(shù):
1、2-琥珀酰-5-烯醇丙酮基-6-羥基-3-環(huán)己烯-1-羧酸(sephchc)合酶,也稱為mend(ec?2.2.1.9)。該酶是一種硫胺素二磷酸(thdp)依賴性的脫羧酶,催化α-酮戊二酸鹽和異溴酸鹽生成sephchc,其催化反應(yīng)的特點(diǎn)是高化學(xué)和區(qū)域選擇性。硫胺素二磷酸(thdp)依賴酶通常在催化過(guò)程中將缺乏電子的羰基底物轉(zhuǎn)化為親核試劑。mend是甲基萘醌和葉綠醌生物合成所必需的,存在于多種細(xì)菌的基因組中。在日用化學(xué)品、食品加工、醫(yī)藥合成等領(lǐng)域廣泛使用,是生物技術(shù)和醫(yī)療應(yīng)用的有前途的靶點(diǎn)。
2、定點(diǎn)突變是指通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pcr)等方法向編碼目的蛋白的dna片段(可以是基因組,也可以是質(zhì)粒)中引入所需變化(通常是表征有利方向的變化),包括堿基的添加、刪除、點(diǎn)突變等。定點(diǎn)突變能迅速、高效的提高dna所表達(dá)的目的蛋白的性狀及表征,是基因研究工作中一種非常有用的手段。體外定點(diǎn)突變技術(shù)是當(dāng)前生物、醫(yī)學(xué)各領(lǐng)域研究中的一種重要實(shí)驗(yàn)手段,是改造、優(yōu)化基因的便捷方案,也是研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能之間的復(fù)雜關(guān)系的有力工具。對(duì)某個(gè)已知基因的特定堿基進(jìn)行定點(diǎn)改變、缺失或者插入,可以改變對(duì)應(yīng)的氨基酸序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),對(duì)突變基因的表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行研究有助于人類了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系,探討蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)/結(jié)構(gòu)域。定點(diǎn)突變技術(shù)的潛在應(yīng)用領(lǐng)域廣泛,如研究蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)、改造酶的不同活性或者動(dòng)力學(xué)特性、提高蛋白的穩(wěn)定性、活性、研究蛋白的晶體結(jié)構(gòu),以及基因治療等。酶的定點(diǎn)突變技術(shù)為酶的結(jié)構(gòu)和功能開(kāi)辟了嶄新的途徑,在工業(yè)、農(nóng)業(yè)、食品業(yè)、環(huán)境等領(lǐng)域取得巨大成功。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明為解決現(xiàn)有技術(shù)問(wèn)題提供了一種酶活力得到顯著提高的sephchc合酶突變體。所述突變體是由枯草芽孢桿菌( bacillus?subtilis)?sephchc合酶基因mend出發(fā),運(yùn)用定點(diǎn)突變技術(shù)獲得的,并在枯草芽孢桿菌中進(jìn)行表達(dá)。
2、本發(fā)明提供一種sephchc合酶突變體,其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第117位氨基酸由gln變?yōu)閍la,突變體的氨基酸序列為seq?id?no:2;
3、或者其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第181位氨基酸由leu變?yōu)閍sn,突變體氨基酸序列為seq?id?no:3;
4、或者其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第88位氨基酸由ala變?yōu)閕le,突變體氨基酸序列為seq?id?no:4;
5、或者其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第112位氨基酸由glu變?yōu)閜ro,突變體氨基酸序列為seq?id?no:5;
6、或者其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第493位氨基酸由leu變?yōu)閍rg,突變體氨基酸序列seq?id?no:6;
7、或者其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第115位氨基酸由ala變?yōu)閠yr,突變體氨基酸序列為seq?id?no:7。
8、本發(fā)明還提供一種sephchc合酶突變體編碼基因,其編碼所述的sephchc合酶突變體。
9、本發(fā)明進(jìn)一步提供一種重組表達(dá)載體,其所述的重組表達(dá)載體攜帶有權(quán)利要求?1所述的sephchc合酶突變體的編碼基因。
10、優(yōu)選地,其出發(fā)表達(dá)載體是pdh1730,且所述編碼基因是由啟動(dòng)子pglv或者pcspd或者pcspb啟動(dòng)。更優(yōu)選地,所述編碼基因整合位點(diǎn)是amye或者ldh或者apre。
11、最優(yōu)選地,所述編碼基因是啟動(dòng)子pcspd啟動(dòng),且整合位點(diǎn)為ldh。
12、本發(fā)明提供一種重組宿主細(xì)胞,所述的重組宿主細(xì)胞為轉(zhuǎn)化/轉(zhuǎn)染有權(quán)利要求3-6任一項(xiàng)所述的重組表達(dá)載體的宿主細(xì)胞,優(yōu)選地所述的宿主細(xì)胞為枯草芽孢桿菌( bacillus?subtilis)。
13、本發(fā)明也提供所述的sephchc合酶突變體或其編碼基因在制備七烯甲萘醌中的應(yīng)用。
14、本發(fā)明因此也提供一種制備七烯甲萘醌的方法,其培養(yǎng)所述的重組宿主細(xì)胞以產(chǎn)生七烯甲萘醌。
15、優(yōu)選地,還包括收集和純化七烯甲萘醌的步驟;更優(yōu)選地,培養(yǎng)時(shí)采用的發(fā)酵培養(yǎng)基組成為:甘油3%,大豆蛋白胨6%,酵母粉0.5%,k2hpo4?0.3%,mgso4??7h2o?0.5%,l-tryptophan?0.1%,麥芽糖3%;培養(yǎng)時(shí)條件為40?℃、200?rpm振蕩培養(yǎng)96?h。
16、本發(fā)明以來(lái)源于枯草芽孢桿菌的sephchc合酶mend為基礎(chǔ),通過(guò)定點(diǎn)突變技術(shù)獲得了六個(gè)sephchc合酶突變體mend-1、mend-2、mend-3、mend-4、mend-5和mend-6,并在枯草芽孢桿菌中對(duì)上述突變體進(jìn)行了發(fā)酵,其發(fā)酵七烯甲萘醌的產(chǎn)量分別為70.77?mg/l、75.48mg/l、81.72?mg/l、88.41?mg/l?、99.88?mg/l和133.40?mg/l,分別是表達(dá)野生型sephchc合酶mend的枯草芽孢桿菌七烯甲萘醌產(chǎn)量的116%、123%、134%、144%、162%和218%。
1.一種sephchc合酶突變體,其氨基酸序列為seq?id?no:1的芳香類異戊烯基轉(zhuǎn)移酶mend的第117位氨基酸由gln變?yōu)閍la,突變體的氨基酸序列為seq?id?no:2;
2.一種sephchc合酶突變體編碼基因,其編碼權(quán)利要求?1所述的sephchc合酶突變體。
3.一種重組表達(dá)載體,其特征在于,所述的重組表達(dá)載體攜帶有權(quán)利要求?1所述的sephchc合酶突變體的編碼基因。
4.如權(quán)利要求3所述的重組表達(dá)載體,其特征在于,其出發(fā)表達(dá)載體是pdh1730,且所述編碼基因是由啟動(dòng)子pglv或者pcspd或者pcspb啟動(dòng)。
5.如權(quán)利要求4所述的重組表達(dá)載體,其特征在于,所述編碼基因整合位點(diǎn)是amye或者ldh或者apre。
6.如權(quán)利要求4所述的重組表達(dá)載體,其特征在于,所述編碼基因是啟動(dòng)子pcspd啟動(dòng),且整合位點(diǎn)為ldh。
7.一種重組宿主細(xì)胞,其特征在于,所述的重組宿主細(xì)胞為轉(zhuǎn)化/轉(zhuǎn)染有權(quán)利要求3-6任一項(xiàng)所述的重組表達(dá)載體的宿主細(xì)胞,優(yōu)選地所述的宿主細(xì)胞為枯草芽孢桿菌(bacillus?subtilis)。
8.權(quán)利要求?1所述的sephchc合酶突變體或其編碼基因在制備七烯甲萘醌中的應(yīng)用。
9.一種制備七烯甲萘醌的方法,其特征在于,培養(yǎng)如權(quán)利要求7所述的重組宿主細(xì)胞以產(chǎn)生七烯甲萘醌。
10.如權(quán)利要求9所述的方法,其特征在于,還包括收集和純化七烯甲萘醌的步驟;優(yōu)選地,培養(yǎng)時(shí)采用的發(fā)酵培養(yǎng)基組成為:甘油3%,大豆蛋白胨6%,酵母粉0.5%,k2hpo40.3%,mgso4??7h2o?0.5%,l-?tryptophan?0.1%,麥芽糖3%;培養(yǎng)時(shí)條件為40?℃、200rpm振蕩培養(yǎng)96?h。