本發(fā)明屬于基因工程領(lǐng)域,具體涉及一種啟動子、基因編輯方法及其應用。
背景技術(shù):
1、基因編輯是對物種進行性狀改良的有效工具。除了能夠?qū)蜻M行編輯外,也可以對啟動子進行編輯,通過改變啟動子特性改變基因的表達,從而實現(xiàn)性狀改良的效果。例如,修飾水稻ossweet基因啟動子可以提高水稻對白葉枯病的抗性(oliva,r.,ji,c.,atienza-grande,g.et?al.broad-spectrum?resistance?to?bacterial?blight?in?riceusing?genome?editing[j].nat?biotechnol.,2019,37,1344-1350);編輯番茄中的slclv3等啟動子可以獲得連續(xù)變化的表型,從而可以對表型進行微調(diào)(rodríguez-leal?d,lemmonz?h,man?j,et?al.engineering?quantitative?trait?variation?for?crop?improvementby?genome?editing[j].cell,2017,171:470-480.e8.)。
2、ehd1是水稻中的重要花期調(diào)控基因。對ehd1啟動子區(qū)域的編輯可以延遲水稻的開花期/抽穗期,例如cn108841855a和cn117625602a。然而本領(lǐng)域尚無法通過編輯ehd1基因或啟動子實現(xiàn)水稻開花期/抽穗期的提早。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的是提供一種新型啟動子。
2、為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
3、本發(fā)明提供一種啟動子,其特征在于:所述啟動子序列如seq?id?no.12或seq?idno.13所示。
4、本發(fā)明還提供一種表達盒,其特征在于:由上述的啟動子、編碼seq?id?no.2所示氨基酸序列的核酸分子、seq?id?no.3所示序列的終止子順序連接而成。
5、在一些實施方案中,上述編碼seq?id?no.2所示氨基酸序列的核酸分子的核苷酸序列如seq?id?no.4或seq?id?no.5所示。
6、本發(fā)明還提供一種提早水稻開花期的方法,其特征在于:包括如下任一種:
7、(1)使用基因工程手段靶向修改seq?id?no.1所示的水稻基因組區(qū)域序列,選擇水稻開花期提前的植株;
8、(2)將含有權(quán)利要求2所述的表達盒插入水稻基因組,選擇水稻開花期提早的植株。
9、在一些實施方案中,上述的基因工程手段采用crispr/cas9基因編輯方法。
10、本發(fā)明還提供一種提早水稻開花期的試劑盒,其特征在于:包括如下任一種:
11、(1)能夠同時識別seq?id?no.6和seq?id?no.7所示靶標序列的rna分子,或能夠同時識別seq?id?no.6和seq?id?no.8所示靶標序列的rna分子;
12、(2)編碼(1)所述rna的dna分子;
13、(3)表達(1)所述rna的載體。
14、在一些實施方案中,上述的試劑盒還包括cas9蛋白或編碼cas9蛋白的核酸分子或表達cas9蛋白的載體。
15、在一些實施方案中,上述的rna分子為seq?id?no.9和seq?id?no.10所示序列的組合,或seq?id?no.9和seq?id?no.11所示序列的組合。
16、本發(fā)明還提供上述的啟動子在增強基因表達中的應用。
17、本發(fā)明還提供上述的表達盒、方法、試劑盒在提早水稻開花期中的應用。
18、本發(fā)明的創(chuàng)新性及有益效果如下:在啟動子結(jié)構(gòu)的復雜性和不可預測性的背景下,本發(fā)明獲得了一種新型的啟動子。該啟動子能夠具有提早水稻開花期的技術(shù)效果。
1.一種啟動子,其特征在于:所述啟動子序列如seq?id?no.12或seq?id?no.13所示。
2.表達盒,其特征在于:由權(quán)利要求1所述的啟動子、編碼seq?id?no.2所示氨基酸序列的核酸分子、seq?id?no.3所示序列的終止子順序連接而成;任選地,所述編碼seq?id?no.2所示氨基酸序列的核酸分子的核苷酸序列如seq?id?no.4或seq?id?no.5所示。
3.一種提早水稻開花期的方法,其特征在于:包括如下任一種:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于:所述的基因工程手段采用crispr/cas9基因編輯方法。
5.一種提早水稻開花期的試劑盒,其特征在于:包括如下任一種:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于:所述的試劑盒還包括cas9蛋白或編碼cas9蛋白的核酸分子或表達cas9蛋白的載體。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于:所述的rna分子為seq?id?no.9和seq?idno.10所示序列的組合,或seq?id?no.9和seq?id?no.11所示序列的組合。
8.權(quán)利要求1所述的啟動子在增強基因表達中的應用。
9.權(quán)利要求2所述的表達盒、權(quán)利要求3-4任一項所述的方法、權(quán)利要求5-7任一項所述的試劑盒在提早水稻開花期中的應用。