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背景敏感醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)輸入系統(tǒng)的制作方法

文檔序號(hào):10579042閱讀:391來源:國知局
背景敏感醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)輸入系統(tǒng)的制作方法
【專利摘要】一種用于提供可執(zhí)行注釋的系統(tǒng),包括:臨床數(shù)據(jù)庫,其存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔。自然語言處理引擎,其處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù)。背景提取和分類引擎,其根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)生成臨床背景信息。注釋推薦引擎,其基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表。臨床接口引擎,其生成顯示可選擇的推薦的注釋的列表的用戶接口。
【專利說明】
背景敏感醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)輸入系統(tǒng)
技術(shù)領(lǐng)域
[0001]本申請(qǐng)總體涉及以需要最小用戶交互的背景敏感的方式來提供背景敏感的可執(zhí)行(act1nable)注釋。本申請(qǐng)尤其與確定使得用戶能夠使用與注釋相關(guān)的信息的背景敏感的注釋列表結(jié)合應(yīng)用,并且將具體參考其加以描述。然而,應(yīng)當(dāng)理解,本申請(qǐng)也應(yīng)用于其他使用情形,而不必限于上述應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002]典型的放射學(xué)工作流涉及醫(yī)師首先讓患者去往放射學(xué)成像設(shè)施以執(zhí)行一些成像。在已經(jīng)使用X射線、CT、MRI(或者一些其他模態(tài))執(zhí)行了成像研究之后,圖像被傳送到使用醫(yī)學(xué)數(shù)字成像和通信(DICOM)標(biāo)準(zhǔn)的影像歸檔和通信系統(tǒng)(PACS)。放射科醫(yī)師閱讀存儲(chǔ)在PACS中的圖像并且使用專用報(bào)告軟件來生成放射學(xué)報(bào)告。
[0003]在典型的放射學(xué)閱讀工作流中,放射學(xué)醫(yī)師將仔細(xì)瀏覽成像研究并且注釋特定感興趣區(qū)域,例如能夠在圖像上觀察到鈣化或腫瘤的區(qū)域。當(dāng)前的圖像查看工具(例如,PACS)主要通過提供放射科醫(yī)師能夠從中選擇的靜態(tài)注釋列表(有時(shí)通過解剖結(jié)構(gòu)進(jìn)行分組)來支持圖像注釋工作流。放射科醫(yī)師能夠從該列表選擇合適的注釋(例如,“鈣化”),或者備選地,選擇類屬“文本”工具并且例如通過鍵入輸入與注釋相關(guān)的描述作為自由文本(例如,“右心臟邊界病變”)。該注釋然后將與圖像相關(guān)聯(lián),并且在需要時(shí)能夠創(chuàng)建鍵圖像。
[0004]該工作流具有兩個(gè)缺點(diǎn);首先,從長(zhǎng)列表選擇最合適的注釋是耗時(shí)、易于出錯(cuò)的,并且不促進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)化描述(例如,肝臟腫塊vs.肝臟中的腫塊)。第二,注釋被簡(jiǎn)單地附到圖像而不可執(zhí)行(例如,需要后續(xù)流程的發(fā)現(xiàn)能夠在圖像上被注釋,但是該信息不能夠由下游用戶容易地使用一即,不可執(zhí)行)。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005]本申請(qǐng)?zhí)峁┝艘环N確定背景敏感注釋列表的系統(tǒng)和方法,所述背景敏感注釋列表也在“注釋跟蹤器”中被跟蹤,使得用戶能夠使用與注釋相關(guān)的信息。所述系統(tǒng)和方法支持從注釋到圖像的容易的導(dǎo)航,并且提供對(duì)可執(zhí)行項(xiàng)的概覽,從而潛在地改進(jìn)工作流效率。本申請(qǐng)還提供克服上述問題和其他問題的新的、經(jīng)改進(jìn)的方法和系統(tǒng)。
[0006]根據(jù)一個(gè)方面,提供了一種用于提供可執(zhí)行注釋的系統(tǒng)。所述系統(tǒng)包括:臨床數(shù)據(jù)庫,其存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔。自然語言處理引擎,其處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù)。背景提取和分類引擎,其根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息。注釋推薦引擎,其基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表。臨床接口引擎,其生成顯示可選擇的推薦的注釋的列表的用戶接口。
[0007]根據(jù)另一方面,提供了一種用于提供推薦的注釋的系統(tǒng)。所述系統(tǒng)包括一個(gè)或多個(gè)處理器,所述一個(gè)或多個(gè)處理器被編程為:存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔;處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù);根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息;基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表;并且生成顯示可選擇的推薦的注釋的列表的用戶接□ O
[0008]根據(jù)另一方面,提供了一種用于提供推薦的注釋的方法,所述方法包括:存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔;處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù);根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息;基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表;并且生成顯示可選擇的推薦的注釋的列表的用戶接口。
[0009]一個(gè)優(yōu)點(diǎn)在于向用戶提供背景敏感的靶向注釋列表。
[0010]另一優(yōu)點(diǎn)在于使得用戶能夠?qū)⒖蓤?zhí)行事件(例如,“隨訪”,“腫瘤委員會(huì)會(huì)議”)與注釋相關(guān)聯(lián)。
[0011]另一優(yōu)點(diǎn)在于使得用戶能夠?qū)⑴c內(nèi)容相關(guān)的注釋直接插入到最終報(bào)告中。
[0012]另一優(yōu)點(diǎn)在于提供能夠被用于增強(qiáng)的注釋到圖像導(dǎo)航的現(xiàn)有注釋的列表。
[0013]另一優(yōu)點(diǎn)在于改進(jìn)的臨床工作流。
[0014]另一優(yōu)點(diǎn)在于改進(jìn)的患者護(hù)理。
[0015]本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在閱讀和理解了以下詳細(xì)描述之后將認(rèn)識(shí)到本發(fā)明的進(jìn)一步的優(yōu)點(diǎn)。
【附圖說明】
[0016]本發(fā)明可以采取各種部件和部件布置的形式,并且可以采取各種步驟和步驟安排的形式。附圖僅出于圖示優(yōu)選實(shí)施例的目的,而不應(yīng)當(dāng)被解讀為限對(duì)本發(fā)明。
[0017]圖1圖示了根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的醫(yī)學(xué)機(jī)構(gòu)的IT基礎(chǔ)架構(gòu)的方框圖。
[0018]圖2圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的示范性實(shí)施例。
[0019]圖3圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0020]圖4圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0021]圖5圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0022]圖6圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0023]圖7圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0024]圖8圖示了由根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的臨床支持系統(tǒng)所生成的臨床背景接口的另一示范性實(shí)施例。
[0025]圖9圖示了根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的用于生成主發(fā)現(xiàn)列表以提供推薦的注釋的列表的方法的流程圖。
[0026]圖10圖示了根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的用于確定相關(guān)發(fā)現(xiàn)的方法的流程圖。
[0027]圖11圖示了根據(jù)本申請(qǐng)的各方面的用于提供推薦的注釋的方法的流程圖。
【具體實(shí)施方式】
[0028]參考圖1,方框圖圖示了諸如醫(yī)院的醫(yī)學(xué)機(jī)構(gòu)的IT基礎(chǔ)架構(gòu)10的一個(gè)實(shí)施例。IT基礎(chǔ)架構(gòu)10適當(dāng)?shù)匕ń?jīng)由通信網(wǎng)絡(luò)20互連的臨床信息系統(tǒng)12、臨床支持系統(tǒng)14、臨床接口系統(tǒng)16等。想到了通信網(wǎng)絡(luò)20包括互聯(lián)網(wǎng)、內(nèi)聯(lián)網(wǎng)、局域網(wǎng)、廣域網(wǎng)、無線網(wǎng)絡(luò)、有線網(wǎng)絡(luò)、蜂窩網(wǎng)絡(luò)、數(shù)據(jù)總線等中的一個(gè)或多個(gè)。也應(yīng)該認(rèn)識(shí)到,IT基礎(chǔ)架構(gòu)的部件被定位在中心位置處或者定位在多個(gè)遠(yuǎn)程位置處。
[0029]臨床信息系統(tǒng)12將包括放射學(xué)報(bào)告、病理學(xué)報(bào)告、實(shí)驗(yàn)室報(bào)告、實(shí)驗(yàn)室/成像報(bào)告、電子健康記錄、EMR數(shù)據(jù)等的臨床文檔存儲(chǔ)在臨床信息數(shù)據(jù)庫22中。臨床文檔可以包括具有與諸如患者的實(shí)體相關(guān)的信息的文檔。臨床文檔中的一些可以是自由文本文檔,而其他文檔可以是結(jié)構(gòu)化文檔。這樣的結(jié)構(gòu)化文檔可以是由計(jì)算機(jī)程序基于用戶通過以電子形式填入而提供的數(shù)據(jù)生成的文檔。例如,結(jié)構(gòu)化文檔可以是XML文檔。結(jié)構(gòu)化文檔可以包括自由文本部分。這樣的自由文本部分可以被視為封裝在結(jié)構(gòu)化文檔內(nèi)的自由文本文檔。因此,結(jié)構(gòu)化文檔的自由文本部分可以由系統(tǒng)處置為自由文本文檔。所述臨床文檔中的每個(gè)臨床文檔包含信息項(xiàng)的列表。信息項(xiàng)的列表包括自由文本的字符串,諸如短語、句子、段落、詞語等。所述臨床文檔的信息項(xiàng)能夠被自動(dòng)地和/或人工地生成。例如,各種臨床系統(tǒng)從先前的臨床文檔、談話的筆錄等自動(dòng)地生成信息項(xiàng)。對(duì)于后者,能夠采用用戶輸入設(shè)備24。在一些實(shí)施例中,臨床信息系統(tǒng)12包括顯示設(shè)備26,所述顯示設(shè)備向用戶提供用戶接口,以在所述用戶接口內(nèi)人工輸入信息項(xiàng)和/或用于顯示臨床文檔。在一個(gè)實(shí)施例中,臨床文檔被本地存儲(chǔ)在臨床信息數(shù)據(jù)庫22中。在另一實(shí)施例中,臨床文檔被全國性地或地域性地存儲(chǔ)在臨床信息數(shù)據(jù)庫22中?;颊咝畔⑾到y(tǒng)的范例包括,但不局限于,電子醫(yī)學(xué)記錄系統(tǒng)、部門系統(tǒng)等。
[0030]臨床支持系統(tǒng)14利用自然語言處理和模式識(shí)別來檢測(cè)臨床文檔內(nèi)的相關(guān)發(fā)現(xiàn)特異性信息。臨床支持系統(tǒng)14還根據(jù)由用戶當(dāng)前觀察到的包括最特異的器官的臨床文檔來生成臨床背景信息。具體而言,臨床支持系統(tǒng)14連續(xù)地監(jiān)測(cè)來自用戶的被觀察到的當(dāng)前圖像和相關(guān)發(fā)現(xiàn)特異性信息以確定臨床背景信息。臨床支持系統(tǒng)基于所確定的臨床背景信息來確定可能的注釋的列表或集合。臨床支持系統(tǒng)14還跟蹤與給定患者相關(guān)聯(lián)的注釋連同相關(guān)元數(shù)據(jù)(例如,相關(guān)聯(lián)的器官、注釋的類型一例如腫塊、動(dòng)作一例如,“隨訪”)。臨床支持系統(tǒng)14還成用戶接口,所述用戶接口使得用戶能夠容易地對(duì)感興趣區(qū)域進(jìn)行注釋,指示針對(duì)注釋的動(dòng)作的類型,使得用戶能夠?qū)⑴c信息相關(guān)的注釋直接插入到報(bào)告中,并且查看所有在先注釋的列表,并且在需要時(shí)導(dǎo)航到對(duì)應(yīng)的圖像。臨床支持系統(tǒng)14包括用于顯示信息項(xiàng)和用戶接口的顯示器44(諸如CRT顯示器、液晶顯示器、發(fā)光二極管顯示器)以及供臨床醫(yī)師輸入和/或修改所提供的信息項(xiàng)的用戶輸入設(shè)備46(諸如鍵盤和鼠標(biāo))。
[0031]具體而言,臨床支持系統(tǒng)14包括自然語言處理引擎30,所述自然語言處理器引擎處理所述臨床文檔以檢測(cè)所述臨床文檔中的信息項(xiàng)并且檢測(cè)相關(guān)臨床發(fā)現(xiàn)和信息的預(yù)定義列表。為了實(shí)現(xiàn)這一操作,自然語言處理引擎30將臨床文檔分割成包括片斷、段落、句子、詞語等的信息項(xiàng)。通常,除了臨床歷史、技術(shù)、比較、發(fā)現(xiàn)、印象片斷標(biāo)頭等之外,臨床文檔包含具有協(xié)議信息的帶時(shí)間戳記的標(biāo)頭。能夠使用片斷標(biāo)頭的預(yù)定義列表和文本匹配技術(shù)來容易地檢測(cè)片斷的內(nèi)容。備選地,能夠使用第三方軟件方法,諸如MedLEEο例如,如果給出了預(yù)定義項(xiàng)的列表(“肺結(jié)節(jié)”),則能夠使用字符串匹配技術(shù)來檢測(cè)各項(xiàng)中的一項(xiàng)是否存在于給定的信息項(xiàng)中。所述字符串匹配技術(shù)還能夠被增強(qiáng)以考慮形態(tài)和詞法變體(肺結(jié)節(jié)=肺部結(jié)節(jié)=肺部的結(jié)節(jié))和分布在信息項(xiàng)上的術(shù)語(肺部中的結(jié)節(jié)=肺結(jié)節(jié))。如果術(shù)語的預(yù)定義列表包含本體ID,則能夠使用概念提取方法來從給定的信息項(xiàng)中提取概念。所述ID指的是背景本體中的概念,諸如SNOMED或RadLex。對(duì)于概念提取,能夠利用第三方解決方案,例如,MetaMap。此外,自然語言處理技術(shù)在本領(lǐng)域中本身是已知的。能夠應(yīng)用諸如模板匹配的技術(shù),和對(duì)在本體中定義的概念實(shí)例的識(shí)別,以及概念實(shí)例之間的關(guān)系,來建立如由自由文本表達(dá)的語義概念的實(shí)例及其關(guān)系的網(wǎng)絡(luò)。
[0032]臨床支持系統(tǒng)14還包括背景提取引擎32,所述背景提取引擎確定由用戶所觀察到的最特異性的(一個(gè)或多個(gè))器官,以確定臨床背景信息。例如,當(dāng)在臨床接口系統(tǒng)16中查看研究時(shí),DICOM標(biāo)頭包含解剖結(jié)構(gòu)信息,包括模態(tài)、身體部分、研究/協(xié)議描述、序列信息、取向(例如,軸向、徑向、冠向)以及窗口類型(諸如,“肺”、“肝”),其被用于確定臨床背景信息。標(biāo)準(zhǔn)圖像分割算法,諸如閾值化、k均值聚類、基于壓縮的方法、區(qū)域生長(zhǎng)方法以及基于偏微分方程的方法,也被用于確定臨床背景信息。在一個(gè)實(shí)施例中,背景提取引擎32利用算法來檢索針對(duì)給定切片數(shù)和其他元數(shù)據(jù)(例如,患者年齡、性別和研究描述)的解剖結(jié)構(gòu)的列表。作為范例,背景提取引擎32創(chuàng)建查找表,所述查找表針對(duì)大量患者存儲(chǔ)針對(duì)患者參數(shù)(例如,年齡、性別)以及研究參數(shù)的對(duì)應(yīng)的解剖結(jié)構(gòu)信息。該表然后能夠被用于從切片數(shù)和可能的額外信息(諸如患者年齡、性別、切片厚度以及切片的數(shù))來估計(jì)器官。更具體地,例如,給定切片125、女性以及“CT腹部”研究描述,算法將返回與該切片數(shù)相關(guān)聯(lián)的器官的列表(例如,“肝”、“腎”、“脾”)。該信息然后由背景提取引擎32用于生成臨床背景信息。
[0033]背景提取引擎32還提取臨床發(fā)現(xiàn)和信息以及所提取的臨床發(fā)現(xiàn)和信息的背景以確定臨床背景信息。具體而言,背景提取引擎32從臨床文檔提取臨床發(fā)現(xiàn)和信息并生成臨床背景信息。為了完成這一操作,背景提取引擎32利用現(xiàn)有的自然語言處理算法,如MedLEE和MetaMap,來提取臨床發(fā)現(xiàn)和信息。另外,背景提取引擎32能夠利用用戶定義的規(guī)則來提取可以出現(xiàn)在文檔中的特定類型的發(fā)現(xiàn)。此外,背景提取引擎32能夠利用當(dāng)前研究和臨床路徑的研究類型,其定義了用于劃入/排除診斷、檢查當(dāng)前文檔中的所需的臨床信息的可用性的所需的臨床信息。背景提取引擎32的進(jìn)一步擴(kuò)展允許導(dǎo)出針對(duì)臨床信息的給定片塊的背景元數(shù)據(jù)。例如,在一個(gè)實(shí)施例中,背景提取引擎32導(dǎo)出信息項(xiàng)的臨床屬性。背景本體,諸如SNOMED和RadLex,能夠被用于確定信息項(xiàng)是否為診斷或癥狀。本地出產(chǎn)或者第三方解決方案(MetaMap)能夠被用于將信息項(xiàng)映射到本體。背景提取引擎32利用該臨床發(fā)現(xiàn)和信息來確定臨床背景信息。
[0034]臨床支持系統(tǒng)14還包括注釋推薦引擎34,所述注釋推薦引擎利用臨床背景信息來確定最合適(即,背景敏感)的注釋集合。在一個(gè)實(shí)施例中,注釋推薦引擎34創(chuàng)建并存儲(chǔ)(例如,經(jīng)由將該信息存儲(chǔ)在數(shù)據(jù)庫中)研究描述到注釋映射的列表。例如,這可以包含與模態(tài)=CT和身體部分=胸部相關(guān)的多個(gè)可能注釋。對(duì)于研究描述CT CHEST(胸部),背景提取引擎32能夠確定正確的模態(tài)和身體部分,并使用映射表來確定合適的注釋集合。此外,類似于先前實(shí)施例的映射表能夠由注釋推薦引擎34針對(duì)被提取的各種解剖結(jié)構(gòu)來創(chuàng)建。然后,能夠針對(duì)給定解剖結(jié)構(gòu)(例如,肝臟)的注釋列表來查詢?cè)摫怼T诹硪粚?shí)施例中,解剖結(jié)構(gòu)和注釋兩者能夠被自動(dòng)地確定。能夠使用標(biāo)準(zhǔn)自然語言處理技術(shù)來對(duì)大數(shù)量的現(xiàn)有報(bào)告進(jìn)行語法分析,從而首先識(shí)別包含各種解剖結(jié)構(gòu)的句子(例如,由先前實(shí)施例識(shí)別的),并且然后對(duì)在其中發(fā)現(xiàn)解剖結(jié)構(gòu)的句子進(jìn)行語法分析以進(jìn)行注釋。備選地,能夠?qū)Ρ话谙嚓P(guān)段落標(biāo)頭內(nèi)的所有句子進(jìn)行語法分析,以創(chuàng)建屬于該解剖結(jié)構(gòu)的注釋列表(例如,在段落標(biāo)頭“LIVER(肝臟)”下的所有句子將是與肝臟相關(guān)的)。還能夠通過探索其他技術(shù)(諸如術(shù)語的共同出現(xiàn))以及使用本體/術(shù)語映射技術(shù)識(shí)別句子內(nèi)的注釋(例如,使用為技術(shù)發(fā)展水平引擎的MetaMap來提取統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)概念),來擴(kuò)大/過濾該列表。該技術(shù)自動(dòng)創(chuàng)建映射表,并且針對(duì)給定解剖結(jié)構(gòu)能夠返回相關(guān)注釋的列表。在另一實(shí)施例中,能夠處理RSNA報(bào)告模板以確定針對(duì)器官的共有的發(fā)現(xiàn)。在又一實(shí)施例中,能夠利用針對(duì)研究的檢查的原因。使用NLP來提取關(guān)于臨床跡象和癥狀以及診斷的術(shù)語并且將其添加到查找表。通過這種方式,基于切片數(shù)、模態(tài)、身體部分和臨床指示來實(shí)現(xiàn)/可視化與關(guān)于器官的發(fā)現(xiàn)相關(guān)的建議。
[0035]在另一實(shí)施例中,上文提到的技術(shù)能夠被用在針對(duì)患者的臨床文檔上以針對(duì)給定解剖結(jié)構(gòu)確定針對(duì)患者的最合適的注釋列表。患者特異性注釋能夠用于對(duì)向用戶示出的注釋列表進(jìn)行劃分優(yōu)選順序/分類。在另一實(shí)施例中,注釋推薦引擎34利用句子邊界和名詞短語檢測(cè)器。臨床文檔本質(zhì)上是敘述性的并且通常包含若干機(jī)構(gòu)特異性片斷標(biāo)頭,諸如,給出針對(duì)研究的原因的簡(jiǎn)要描述的臨床信息、涉及相關(guān)現(xiàn)有研究的比較、描述已經(jīng)在圖像中觀察到了什么的發(fā)現(xiàn)以及包含診斷細(xì)節(jié)和后續(xù)推薦的印象。使用自然語言處理作為開始點(diǎn),注釋推薦引擎34確定句子邊界檢測(cè)算法,其識(shí)別敘述性報(bào)告中的片斷、段落和句子以及句子內(nèi)的名詞短語。在另一實(shí)施例中,注釋推薦引擎34利用主要發(fā)現(xiàn)列表來提供推薦的注釋的列表。在該實(shí)施例中,注釋推薦引擎34對(duì)臨床文檔進(jìn)行語法分析以從發(fā)現(xiàn)片斷提取名詞短語,從而生成推薦的注釋。注釋推薦引擎34利用關(guān)鍵字過濾器,使得名詞短語包括常用詞語中的至少一個(gè),諸如“指數(shù)”或者“參考”,因?yàn)檫@些詞語常常在描述發(fā)現(xiàn)時(shí)使用。在另外的實(shí)施例中,注釋推薦引擎34利用相關(guān)現(xiàn)有報(bào)告來推薦注釋。通常,放射科醫(yī)師參考最新近相關(guān)現(xiàn)有報(bào)告來建立臨床背景?,F(xiàn)有報(bào)告通常包含關(guān)于患者的當(dāng)前狀態(tài)的信息,尤其是關(guān)于現(xiàn)有發(fā)現(xiàn)的信息。每個(gè)報(bào)告包含與研究相關(guān)聯(lián)的研究信息,諸如模態(tài)(例如,CT、MR)以及身體部分(例如,頭部、胸部)。注釋推薦引擎34利用兩個(gè)相關(guān)不同現(xiàn)有報(bào)告來建立背景一首先,具有相同模態(tài)和身體部分的最新近現(xiàn)有報(bào)告;第二,具有相同身體部分的最新近現(xiàn)有報(bào)告。給定針對(duì)患者的報(bào)告的集合,注釋推薦引擎34確定針對(duì)給定研究的兩個(gè)相關(guān)現(xiàn)有內(nèi)容。在另一實(shí)施例中,利用描述分類器和過濾器來推薦注釋。給定發(fā)現(xiàn)描述的集合,所述分類使用指定規(guī)則集合來對(duì)列表進(jìn)行分類。注釋推薦引擎34基于從現(xiàn)有報(bào)告提取的句子對(duì)主要發(fā)現(xiàn)列表進(jìn)行分類。注釋推薦引擎34還基于用戶輸入來對(duì)發(fā)現(xiàn)描述列表進(jìn)行過濾。在最簡(jiǎn)單的實(shí)施方式中,注釋推薦引擎34能夠利用針對(duì)過濾的簡(jiǎn)單字符串“包含”類型的操作。所述匹配能夠被限制到在需要時(shí)在任何詞語的開始處進(jìn)行匹配。例如,鍵入“h”將“右心臟邊界病變”包括作為過濾后的匹配的候選中的一個(gè)。類似地,如果需要,則用戶還能夠鍵入由空格分離的多個(gè)字符,以匹配采取任何順序的多個(gè)詞語;例如,“右心臟邊界病變”是針對(duì)“hI”的匹配。在另一實(shí)施例中,通過以實(shí)時(shí)的方式向用戶顯示候選發(fā)現(xiàn)描述的列表來推薦注釋。當(dāng)用戶打開成像研究時(shí),注釋推薦引擎34使用DICOM標(biāo)頭來確定模態(tài)和身體部分信息。然后,使用句子檢測(cè)引擎來對(duì)報(bào)告進(jìn)行語法分析,以從發(fā)現(xiàn)片斷提取句子。然后,使用分類引擎對(duì)主要發(fā)現(xiàn)列表進(jìn)行分類并將其顯示給用戶。在需要時(shí)使用用戶輸入對(duì)列表進(jìn)行過濾。
[0036]臨床支持系統(tǒng)14還包括注釋跟蹤引擎36,所述注釋跟蹤引擎跟蹤針對(duì)患者的所有注釋連同相關(guān)元數(shù)據(jù)。元數(shù)據(jù)包括諸如相關(guān)聯(lián)的器官、注釋的類型(例如,腫塊)、動(dòng)作/推薦(例如,“隨訪”)。該引擎存儲(chǔ)針對(duì)患者的所有注釋。每次新的注釋被創(chuàng)建,表示就被存儲(chǔ)在模塊中。該模塊中的信息隨后由圖形用戶接口用于用戶友好地繪制。
[0037]臨床支持系統(tǒng)14還包括臨床接口引擎38,所述臨床接口引擎生成用戶接口,所述用戶接口使得用戶能夠容易地對(duì)感興趣區(qū)域進(jìn)行注釋,指示針對(duì)注釋的動(dòng)作的類型,使得用戶能夠?qū)⑴c信息相關(guān)的注釋直接插入到報(bào)告中,并且查看所有現(xiàn)有注釋的列表,并且在需要時(shí)導(dǎo)航到對(duì)應(yīng)的圖像。例如,當(dāng)用戶打開研究時(shí),臨床接口引擎38向用戶提供背景敏感(如由背景提取模塊確定的)注釋列表。對(duì)顯示注釋的觸發(fā)能夠包括用戶右鍵敲擊特定切片并且從背景菜單選擇合適的注釋。如圖2所示,如果特定器官不能夠被確定,則系統(tǒng)將基于當(dāng)前切片示出背景敏感器官列表并且用戶能夠選擇最合適的器官,并且然后選擇注釋。如果特定器官能夠被確定,則器官特異性注釋列表將被示出給用戶。在另一實(shí)施例中,利用基于彈出式的用戶接口,其中,用戶能夠通過選擇多個(gè)術(shù)語的合適的組合從背景敏感注釋列表進(jìn)行選擇。例如,圖3示出了已經(jīng)被識(shí)別并顯示給用戶的腎上腺特異性注釋的列表。在該實(shí)例中,用戶已經(jīng)選擇了各選項(xiàng)的組合來指示存在“在左側(cè)和右側(cè)腎上腺中的鈣化病變”。建議的注釋的列表將隨每解剖結(jié)構(gòu)而不同。在另一實(shí)施例中,通過用戶將鼠標(biāo)移動(dòng)在由圖像分割算法識(shí)別的區(qū)域內(nèi)部并且指示針對(duì)注釋的期望來推薦注釋(例如,通過雙擊圖像上的感興趣區(qū)域)。在又一實(shí)施例中,臨床接口引擎38利用眼睛跟蹤類型的技術(shù)來檢測(cè)眼睛移動(dòng)并使用其他感官信息(例如,注視、停留時(shí)間)來確定感興趣區(qū)域并提供推薦的注釋。還應(yīng)當(dāng)預(yù)期用戶接口使得用戶能夠?qū)Ω鞣N類型的臨床文檔進(jìn)行注釋。
[0038]臨床接口引擎38還使得用戶能夠使用被標(biāo)記為可執(zhí)行的注釋來對(duì)臨床文檔進(jìn)行注釋。如果臨床文檔的內(nèi)容是結(jié)構(gòu)化的或者容易利用基本映射方法進(jìn)行結(jié)構(gòu)化并且如果所述結(jié)構(gòu)具有預(yù)定義的語義內(nèi)涵,則所述臨床文檔是可執(zhí)行的。通過這種方式,注釋可以指示“該病變需要活檢”。注釋隨后能夠由活檢管理系統(tǒng)拾取,所述活檢管理系統(tǒng)然后創(chuàng)建被鏈接到檢查和注釋在其上被實(shí)現(xiàn)的圖像的活檢條目。例如,圖4示出了圖像已經(jīng)如何被注釋,指示這作為“教導(dǎo)文件”是重要的。類似地,圖12中示出的用戶接口能夠被擴(kuò)大,從而也捕獲可執(zhí)行信息。例如,圖5指示“在左側(cè)和右側(cè)腎上腺中觀察到的鈣化病變”需要如何被“監(jiān)測(cè)”并且也被用作“教導(dǎo)文件”。圖6中示出的用戶接口能夠通過使用算法進(jìn)一步細(xì)化,其中,基于患者歷史,僅患者特異性注釋列表被示出給用戶。用戶還能夠選擇將自動(dòng)填充相關(guān)聯(lián)的元數(shù)據(jù)的現(xiàn)有注釋(例如,來自下拉表)。備選地,用戶能夠敲擊相關(guān)選項(xiàng)或者鍵入該信息。在另一實(shí)施例中,用戶接口也支持將注釋插入到放射學(xué)報(bào)告中。在第一實(shí)施方式中,這可以包括允許用戶將所有注釋的自由文本繪制復(fù)制到“微軟剪貼板”中。注釋繪制能夠從這里容易地被粘貼到報(bào)告中。在另一實(shí)施例中,用戶接口還支持對(duì)在“注釋跟蹤器”模塊中保持的注釋的用戶友好地繪制。例如,在圖7中可以看到一種實(shí)施方式。在該實(shí)例中,注釋日期被示出在列中,而注釋類型被示出在每行中。所述接口還能夠被增強(qiáng)以支持不同類型的繪制(例如,由代替注釋類型的解剖結(jié)構(gòu)分組),以及過濾。注釋文本被超鏈接到對(duì)應(yīng)的圖像切片,使得敲擊其將自動(dòng)打開包含注釋的圖像(通過打開相關(guān)聯(lián)的研究和聚焦到相關(guān)圖像的設(shè)置)。在另一實(shí)施例中,如在圖8中所示,基于由用戶鍵入的字符來提供推薦的注釋。例如,通過對(duì)鍵入字符“r”的鍵入,接□將基于臨床背景顯示“右心臟邊界病”變作為最理想的注釋。
[0039]臨床接口系統(tǒng)16顯示用戶接口,使得用戶能夠容易地對(duì)感興趣區(qū)域進(jìn)行注釋,指示針對(duì)注釋的動(dòng)作的類型,使得用戶能夠?qū)⑴c注釋相關(guān)的信息直接插入到報(bào)告中,并且查看所有現(xiàn)有注釋的列表,并且在需要時(shí)導(dǎo)航到對(duì)應(yīng)的圖像。臨床接口顯示系統(tǒng)16接收用戶接口,并且在顯示器48上向護(hù)理提供者顯示視圖。臨床接口系統(tǒng)16還包括用戶輸入設(shè)備50,諸如觸摸屏或者鍵盤和鼠標(biāo),以供醫(yī)師輸入和/或修改用戶接口視圖。護(hù)理提供者接口系統(tǒng)的范例包括,但不限于,個(gè)人數(shù)字助理(PDA)、蜂窩智能電話、個(gè)人計(jì)算機(jī)等。
[0040]IT基礎(chǔ)架構(gòu)10的部件適合包括運(yùn)行實(shí)現(xiàn)前述功能的計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令的處理器60,其中,所述計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令被存儲(chǔ)在與處理器60相關(guān)聯(lián)的存儲(chǔ)器62上。然而,想到了,前述功能中的至少一些能夠在無需使用處理器的情況下被實(shí)施在硬件中。例如,能夠采用模擬電路系統(tǒng)。此外,IT基礎(chǔ)架構(gòu)10的部件包括向處理器60提供接口的通信單元64,通過所述接口在通信網(wǎng)絡(luò)20上進(jìn)行通信。更重要的是,盡管離散地描述了 IT基礎(chǔ)架構(gòu)10的上述部件,但是應(yīng)當(dāng)認(rèn)識(shí)到,這些部件能夠被組合。
[0041]參考圖9,圖示了用于生成主要發(fā)現(xiàn)列表以提供推薦的注釋的列表的方法的流程圖100。在步驟102中,檢索多個(gè)放射學(xué)檢查。在步驟104中,從多個(gè)放射學(xué)檢查提取DICOM數(shù)據(jù)。在步驟106中,從DICOM數(shù)據(jù)提取信息。在步驟108中,從多個(gè)放射學(xué)檢查提取放射學(xué)報(bào)告。在步驟110中,在放射學(xué)報(bào)告上使用句子檢測(cè)。在步驟112中,在放射學(xué)報(bào)告上使用測(cè)量檢測(cè)。在步驟114中,在放射學(xué)報(bào)告上使用概念和名稱短語提取。在步驟116中,在放射學(xué)報(bào)告上執(zhí)行基于頻率的規(guī)范化和選擇。在步驟118中,確定發(fā)現(xiàn)主列表。
[0042]參考圖10,圖示了用于確定相關(guān)發(fā)現(xiàn)的方法的流程圖200。為了加載新的研究,在步驟202中檢索當(dāng)前研究。在步驟204中,從研究提取DICOM數(shù)據(jù)。在步驟206中,基于DICOM數(shù)據(jù)來確定相關(guān)現(xiàn)有報(bào)告。在步驟208中,在相關(guān)現(xiàn)有報(bào)告上使用句子提取。在步驟210中,在相關(guān)現(xiàn)有報(bào)告的發(fā)現(xiàn)片段上執(zhí)行句子提取。在步驟212中檢索主要發(fā)現(xiàn)列表。在步驟214中,基于主要發(fā)現(xiàn)列表來執(zhí)行基于詞語的索引和指紋創(chuàng)建。為了對(duì)病變進(jìn)行注釋,在步驟216中檢索當(dāng)前圖像。在步驟218中,提取來自當(dāng)前圖像的DICOM數(shù)據(jù)。在步驟220中,基于句子提取和基于詞語的索引和指紋創(chuàng)建來對(duì)注釋進(jìn)行分類。在步驟222中,提供推薦的注釋的列表。在步驟224中,由用戶輸入當(dāng)前文本。在步驟226中,利用基于詞語的索引和指紋創(chuàng)建來執(zhí)行過濾。在步驟228中,利用DICOM數(shù)據(jù)、過濾和基于詞語的索引和指紋創(chuàng)建來執(zhí)行分類。在步驟230中,提供基于輸入的用戶特異性發(fā)現(xiàn)。
[0043]參考圖11,圖示了用于確定相關(guān)發(fā)現(xiàn)的方法的流程圖300。在步驟302中,包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔被存儲(chǔ)在數(shù)據(jù)庫中。在步驟304中,處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù)。在步驟306中,根據(jù)臨床數(shù)據(jù)生成臨床背景信息。在步驟308中,基于臨床背景信息生成推薦的注釋的列表。在步驟310中,用戶接口顯示可選擇的推薦的注釋的列表。
[0044]如本文所使用的,存儲(chǔ)器包括以下各項(xiàng)中的一個(gè)或多個(gè):非瞬態(tài)計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì);磁盤或其他磁性存儲(chǔ)介質(zhì);光盤或其他光學(xué)存儲(chǔ)介質(zhì);隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(RAM)、只讀存儲(chǔ)器(ROM)或其他電子存儲(chǔ)器設(shè)備或芯片或一組操作性互連的芯片;互聯(lián)網(wǎng)/內(nèi)聯(lián)網(wǎng)服務(wù)器,可以從其中經(jīng)由互聯(lián)網(wǎng)/內(nèi)聯(lián)網(wǎng)或局域網(wǎng)檢索所存儲(chǔ)的指令;等。此外,如本文所使用的,處理器包括以下各項(xiàng)中的一個(gè)或多個(gè):微處理器、微控制器、圖形處理單元(GPU)、專用集成電路(ASIC)、現(xiàn)場(chǎng)可編程門陣列(FPGA)、個(gè)人數(shù)字助理(PDA)、蜂窩智能電話、移動(dòng)手表、計(jì)算眼鏡以及類似的身體配戴、植入或攜帶的可移動(dòng)用具;用戶輸入設(shè)備包括以下各項(xiàng)中的一個(gè)或多個(gè):鼠標(biāo)、鍵盤、觸摸屏顯示器、一個(gè)或多個(gè)按鈕、一個(gè)或多個(gè)開關(guān)、一個(gè)或多個(gè)觸發(fā)器等等;并且顯示設(shè)備包括以下各項(xiàng)中的一個(gè)或多個(gè):1XD顯示器、LED顯示器、等離子體顯示器、投影顯示器、觸摸屏顯示器等。
[0045]已經(jīng)參考優(yōu)選實(shí)施例描述了本發(fā)明。其他人在閱讀和理解了以上詳細(xì)描述后可以想到各種修改和變化。本發(fā)明旨在被解讀為包括所有這樣的修改和變化,只要它們落入權(quán)利要求或其等價(jià)方案的范圍內(nèi)。
【主權(quán)項(xiàng)】
1.一種用于提供可執(zhí)行注釋的系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括: 臨床數(shù)據(jù)庫,其存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔; 自然語言處理引擎,其處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù); 背景提取和分類引擎,其根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息; 注釋推薦引擎,其基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表;以及 臨床接口引擎,其生成用戶接口,所述用戶接口顯示可選擇的推薦的注釋的所述列表。2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其中,所述背景提取和分類引擎基于被顯示給用戶的圖像來生成臨床背景信息。3.根據(jù)權(quán)利要求1和2中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),還包括: 注釋跟蹤器,其跟蹤針對(duì)患者的所有注釋連同相關(guān)元數(shù)據(jù)。4.根據(jù)權(quán)利要求1-3中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,用戶接口包括基于菜單的接口,所述基于菜單的接口使得用戶能夠選擇注釋的各種組合。5.根據(jù)權(quán)利要求1-4中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,所述推薦的注釋是可執(zhí)行的。6.根據(jù)權(quán)利要求1-5中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,所述用戶接口包括智能注釋,所述智能注釋使得所述用戶能夠利用最小數(shù)量的鍵擊來選擇注釋。7.根據(jù)權(quán)利要求1-6中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,用戶接口使得所述用戶能夠?qū)⑺x擇的注釋插入到放射學(xué)報(bào)告中。8.一種用于提供推薦注釋的系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括: 一個(gè)或多個(gè)處理器,其被編程為: 存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔; 處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù); 根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息; 基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表;并且 生成用戶接口,所述用戶接口顯示可選擇的推薦的注釋的列表。9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的系統(tǒng),其中,所述一個(gè)或多個(gè)處理器還被編程為: 基于被顯示給所述用戶的圖像來生成臨床背景信息。10.根據(jù)權(quán)利要求8和9中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,所述一個(gè)或多個(gè)處理器還被編程為: 跟蹤針對(duì)患者的所有注釋連同相關(guān)元數(shù)據(jù)。11.根據(jù)權(quán)利要求8-10中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,用戶接口包括基于菜單的接口,所述基于菜單的接口使得所述用戶能夠選擇對(duì)注釋的各種組合。12.根據(jù)權(quán)利要求8-11中的任一項(xiàng)所述的系統(tǒng),其中,所述用戶接口包括可執(zhí)行注釋,所述可執(zhí)行注釋使得所述用戶能夠利用最小數(shù)量的鍵擊來選擇注釋。13.一種用于提供推薦注釋的方法,所述方法包括: 存儲(chǔ)包括臨床數(shù)據(jù)的一個(gè)或多個(gè)臨床文檔; 處理所述臨床文檔以檢測(cè)臨床數(shù)據(jù); 根據(jù)所述臨床數(shù)據(jù)來生成臨床背景信息; 基于所述臨床背景信息來生成推薦的注釋的列表;并且 生成用戶接口,所述用戶接口顯示可選擇的推薦的注釋的所述列表。14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的方法,還包括: 基于被顯示給用戶的圖像來生成臨床背景信息。15.根據(jù)權(quán)利要求13和14中的任一項(xiàng)所述的方法,還包括: 跟蹤針對(duì)患者的所有注釋連同相關(guān)元數(shù)據(jù)。16.根據(jù)權(quán)利要求13-15中的任一項(xiàng)所述的方法,其中,用戶接口包括基于菜單的接口,所述基于菜單的接口使得用戶能夠選擇注釋的各種組合。17.根據(jù)權(quán)利要求15-18中的任一項(xiàng)所述的方法,其中,所述用戶接口包括可執(zhí)行注釋,所述可執(zhí)行注釋使得所述用戶能夠利用最小數(shù)量的鍵擊來選擇注釋。
【文檔編號(hào)】G06F19/00GK105940401SQ201580006281
【公開日】2016年9月14日
【申請(qǐng)日】2015年1月19日
【發(fā)明人】T·D·D·S·馬博杜瓦納, M·塞芬斯特, 錢悅晨
【申請(qǐng)人】皇家飛利浦有限公司
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