本公開涉及腎細(xì)胞癌的治療領(lǐng)域。

背景技術(shù)：

1、透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccrcc)是腎細(xì)胞癌(rcc)最常見的組織學(xué)亞型，占所有rcc病例的70％[1]。手術(shù)(根治性或部分腎切除術(shù))是具有局部腫瘤的患者的標(biāo)準(zhǔn)主要治療方法。具有腎切除術(shù)后復(fù)發(fā)或晚期腫瘤的患者的一線和二線靶向治療選擇包括酪氨酸激酶抑制劑(阿昔替尼(axitinib)、索拉非尼(sorafenib)、帕唑帕尼(pazopanib)和舒尼替尼(sunitinib)等)、mtor抑制劑(依維莫司(everolimus)和坦羅莫司(tesirolimus))以及針對(duì)vegf、pd-1或pd-l1的單克隆抗體(貝伐珠單抗(bevacizumab)、帕博利珠單抗(pembrolizumab)和阿維單抗(avelumab)等)。然而,據(jù)美國(guó)國(guó)家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(nccn，版本：1.2022)報(bào)告，在不同臨床試驗(yàn)中，基于這些藥物的單藥或聯(lián)合方案的應(yīng)答率為6％至50％[2]。而且，這些藥物的平均疾病控制時(shí)間用于一線環(huán)境時(shí)僅為8-9個(gè)月，用于二線環(huán)境時(shí)為5-6個(gè)月[3]。因此，需要發(fā)現(xiàn)耐受性更好且更有效的藥物，以擴(kuò)大用于ccrcc患者的單藥或聯(lián)合方案的選擇范圍。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、基于系統(tǒng)生物學(xué)方法的計(jì)算藥物重定位已成為鑒定潛在藥物-靶標(biāo)相互作用和藥物-疾病相互作用的有力工具[4]。藥物重定位的優(yōu)勢(shì)在于重定位藥物的藥理學(xué)和安全性已得到很好的表征，大大降低了傳統(tǒng)藥物開發(fā)的成本和時(shí)間，并降低了臨床階段的流失風(fēng)險(xiǎn)[5,6]。一般而言，目前的藥物重定位策略可分為基于藥物、基于疾病和基于譜[7]。通常，基于藥物和基于疾病的方法是通過(guò)比較藥物-藥物或疾病-疾病的相似性或應(yīng)用現(xiàn)有的藥物治療知識(shí)來(lái)預(yù)測(cè)新的疾病-藥物關(guān)聯(lián)來(lái)進(jìn)行的[8，9]。相比之下，基于譜的方法是通過(guò)分析與疾病和藥物相關(guān)的高通量多組學(xué)數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)行的，其不依賴于對(duì)特定藥物或疾病的先驗(yàn)知識(shí)，并且提高了發(fā)現(xiàn)新藥物-疾病對(duì)的能力[7]。

2、最近，多項(xiàng)研究已經(jīng)采用了基于譜的重定位方法來(lái)鑒定對(duì)治療ccrcc有潛在價(jià)值的藥物。一種廣泛使用的方法是選擇對(duì)疾病特征基因有相反作用的藥物[10，11]。這種方法的理念是，如果藥物引起的基因表達(dá)擾動(dòng)(藥物擾動(dòng)特征)與腫瘤組織與正常組織相比的失調(diào)(疾病特異性特征)呈負(fù)相關(guān)，則該藥物對(duì)這種腫瘤類型具有治療價(jià)值。在應(yīng)用上述方法的過(guò)程中，connectivitymap(cmap)[12]是最常用的藥物擾動(dòng)基因表達(dá)數(shù)據(jù)源，其最近已更新并整合到lincs數(shù)據(jù)門戶[13]中。迄今為止，lincs數(shù)據(jù)門戶已包括與超過(guò)20,000種藥物、多達(dá)超過(guò)200個(gè)細(xì)胞系中的基因過(guò)表達(dá)和敲減相關(guān)的超過(guò)300萬(wàn)個(gè)基因表達(dá)譜[13]。然而，據(jù)說(shuō)以這種方式重新利用的藥物具有由癌基因和乘客基因混合而成的多種基因靶標(biāo)，這限制了對(duì)藥物作用的關(guān)鍵靶標(biāo)和機(jī)制的鑒定和驗(yàn)證。

3、通過(guò)從靶標(biāo)預(yù)測(cè)開始，然后將靶基因的現(xiàn)有抑制劑重新用于癌癥治療，已經(jīng)避免了這個(gè)問(wèn)題。在之前的研究中，通過(guò)基因組規(guī)模的代謝模型分析鑒定了對(duì)ccrcc腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)至關(guān)重要的候選靶基因列表[14]。在這些必需基因中，通過(guò)對(duì)每個(gè)必需基因進(jìn)行計(jì)算機(jī)毒性測(cè)試，篩選出在32種主要正常人體組織中的其抑制是沒(méi)有毒性的三個(gè)基因soat1、crls1和acacb，作為最終的可靶向基因。最后，soat1的一種眾所周知的抑制劑米托坦(mitotane)被重新利用，并驗(yàn)證了其用于治療ccrcc的藥物療效。然而，這項(xiàng)研究的一個(gè)局限性是需要系統(tǒng)的藥物重定位方法來(lái)發(fā)現(xiàn)更多可能抑制soat1的潛在有效藥物。此外，候選靶基因列表需要擴(kuò)展，并且這種擴(kuò)展不應(yīng)僅限于代謝重要性基因，其僅覆蓋人類基因組的約20-25％(如人類代謝模型[15]中所報(bào)道的)，還應(yīng)包括非代謝性基因。因此，應(yīng)用所有可能的人類基因的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(gcn)分析已用于鑒定關(guān)鍵基因、其鄰居和功能相關(guān)的生物學(xué)功能[5，16]。

4、在本公開的研究中，應(yīng)用了涉及疾病-靶標(biāo)預(yù)測(cè)和藥物-靶標(biāo)預(yù)測(cè)的綜合策略。第一，提取了一組穩(wěn)健的ccrcc特征基因，其表達(dá)與患者的生存結(jié)果顯著相關(guān)。功能富集分析表明，這些基因在細(xì)胞分裂、細(xì)胞周期、dna復(fù)制、血管生成、細(xì)胞遷移和細(xì)胞分化途徑中顯著富集，所有這些都是癌癥中眾所周知的標(biāo)志[17]。第二，基于對(duì)ccrcc組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的gcn分析，鑒定出兩種顯著富集不利和有利特征的分子模塊。第三，提取出在模塊中表現(xiàn)出高中心性的四個(gè)靶基因，即bub1b、rrm2、asf1b和ccnb2。接下來(lái)，基于對(duì)來(lái)自lincs數(shù)據(jù)門戶的shrna擾動(dòng)和藥物擾動(dòng)轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的分析開發(fā)了一種藥物重定位方法，并重新利用了針對(duì)每個(gè)靶標(biāo)的三種最有效的藥物。最后，在caki-1細(xì)胞中測(cè)試了藥物效果。在這些測(cè)試中，藥物tg-101209被證明是有效的。

5、接下來(lái)，本發(fā)明人意識(shí)到可以調(diào)整tg-101209的分子結(jié)構(gòu)，以找到對(duì)ccrcc具有相似或更好效果的替代小分子。

6、因此，根據(jù)第一方面，提供了根據(jù)式(i)的化合物

7、

8、或其藥學(xué)上可接受的鹽或前藥，其中：

9、r1選自

10、

11、r2為

12、z為–h、–ome或–so2-nh2；

13、x為–h、–me、–nhc(o)–ar或–c(o)nh-ar，其中–ar為任選取代的芳基；并且

14、y為–h、–ome或前提是所述化合物不是tg-1012099。

15、根據(jù)式(i)的化合物對(duì)腎細(xì)胞癌細(xì)胞表現(xiàn)出細(xì)胞毒性并降低所處理細(xì)胞的細(xì)胞存活率。因此，本發(fā)明的化合物適用于治療腎細(xì)胞癌，諸如透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccrcc)

16、在一個(gè)實(shí)施方式中，y和z為–h，x為–c(o)nh-ar或–nhc(o)-ar，優(yōu)選為–c(o)nh-ar，并且任選取代的芳基–ar具有一個(gè)或兩個(gè)環(huán)。任選取代的芳基–ar可以選自由任選取代的芐基、萘基、喹啉基、吲哚基和嘌呤基組成的組。

17、在一個(gè)實(shí)施方式中，–ar選自：

18、該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m101a、m101b、m101d、m101f、m101g和m101h，并且使用該實(shí)施方式中的化合物處理與特別低的細(xì)胞存活率相關(guān)。

19、在一個(gè)實(shí)施方式中，–ar為該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m101d，并且使用該實(shí)施方式中的化合物處理細(xì)胞與特別低的細(xì)胞存活率相關(guān)。

20、在一個(gè)實(shí)施方式中，x為–me，y為–h并且z為–so2nh2。該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m66，并且使用該實(shí)施方式中的化合物處理細(xì)胞與特別低的細(xì)胞存活率和bub1b表達(dá)水平的降低相關(guān)。

21、在一個(gè)實(shí)施方式中，r2為優(yōu)選地r2為該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m5、m7、m79和m88，并且使用該實(shí)施方式的化合物處理細(xì)胞與特別低的細(xì)胞存活率和bub1b表達(dá)水平的降低相關(guān)。

22、在一個(gè)實(shí)施方式中，r1為在該實(shí)施方式中，z優(yōu)選為–h或–so2-nh2和/或y優(yōu)選為–h或該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m5，并且使用該實(shí)施方式中的化合物處理細(xì)胞與特別低的細(xì)胞存活率和bub1b表達(dá)水平的降低相關(guān)。

23、在另一個(gè)實(shí)施方式中，r1為該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m66、m79、m88、m101a、m101b、m101d、m101f、m101g和m101h，并且使用該實(shí)施方式的化合物處理細(xì)胞與顯著降低的細(xì)胞存活率相關(guān)。

24、在一個(gè)實(shí)施方式中，r1為該實(shí)施方式包括實(shí)施例部分中的化合物m7，并且使用該實(shí)施方式的化合物處理細(xì)胞與降低的細(xì)胞存活率相關(guān)。

25、在一個(gè)實(shí)施方式中，本發(fā)明不包括式(ii)或(iii)的化合物：

26、

27、用這些化合物處理的細(xì)胞表現(xiàn)出降低的細(xì)胞存活率。然而，其他化合物表現(xiàn)出更大的效果，因此更優(yōu)選。

28、因此，當(dāng)z和y均為-ome時(shí)，r1優(yōu)選為

29、在第一方面的優(yōu)選實(shí)施方式中，化合物為m5、m66、m101a、m101b或m101d或其藥學(xué)上可接受的鹽或前藥。m5、m66、m101a、m101b和m101d的結(jié)構(gòu)在下文公開，例如在表1中。

30、在第一方面的特別優(yōu)選實(shí)施方式中，化合物為m5或m101d或其藥學(xué)上可接受的鹽或前藥。

31、根據(jù)第二方面，提供了包括根據(jù)第一方面的化合物的藥物組合物。

32、根據(jù)第三方面，提供了包括化合物tg-101209的根據(jù)第一或第二方面的化合物或藥物組合物用于治療腎細(xì)胞癌諸如透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccrcc)的用途。ccrcc可以是i-iii期ccrcc，優(yōu)選是i期或ii期ccrcc。

33、因此，化合物tg-101209被排除在第一和第二方面的范圍之外，但不被排除在第三方面的范圍之外。

34、在一個(gè)實(shí)施方式中，治療方法還包括給藥選自由酪氨酸激酶抑制劑(例如阿昔替尼、索拉非尼、帕唑帕尼和舒尼替尼)、mtor抑制劑(例如依維莫司和坦羅莫司)、抗vegf單克隆抗體(例如貝伐珠單抗)組成的組中的藥物。這些藥物與根據(jù)第一或第二方面的化合物或藥物組合物一起給藥可以對(duì)ccrcc的治療具有協(xié)同作用。

35、在另一實(shí)施方式中，治療方法還包括給藥：

36、i)帕比司他；和/或

37、ii)nvp-tae684或醉茄素-a。

38、該實(shí)施方式的組合預(yù)計(jì)具有協(xié)同作用(如下文進(jìn)一步討論)。