背景技術(shù)：

1、奶牛產(chǎn)奶量性狀在畜牧業(yè)中具有極其重要的經(jīng)濟(jì)意義，主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面：1.經(jīng)濟(jì)效益：產(chǎn)奶量是衡量奶牛生產(chǎn)性能的一個(gè)核心指標(biāo)，直接關(guān)聯(lián)到奶牛養(yǎng)殖的經(jīng)濟(jì)效益。高產(chǎn)奶量意味著在相同飼養(yǎng)成本下，能產(chǎn)出更多的牛奶，從而提高農(nóng)場(chǎng)的收入和利潤(rùn)。2.遺傳改良：產(chǎn)奶量作為一種數(shù)量性狀，具有遺傳基礎(chǔ)，通過(guò)遺傳選育，可以不斷優(yōu)化奶牛品種，提升整個(gè)群體的產(chǎn)奶潛力。這對(duì)于長(zhǎng)期提高奶業(yè)生產(chǎn)力至關(guān)重要。3.資源利用效率：提高奶牛的產(chǎn)奶量意味著在相同或更少的資源(如飼料、水、土地)消耗下，能夠產(chǎn)出更多的產(chǎn)品，有利于資源的高效利用和環(huán)境的可持續(xù)發(fā)展。4.市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力：在國(guó)際和國(guó)內(nèi)市場(chǎng)上，高產(chǎn)奶牛所產(chǎn)的牛奶能以更低成本滿足市場(chǎng)需求，增強(qiáng)產(chǎn)品的市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力，促進(jìn)乳品行業(yè)的發(fā)展。5.乳品工業(yè)原料供應(yīng)：乳制品行業(yè)的原料主要來(lái)源于牛奶，穩(wěn)定的高產(chǎn)奶量保證了乳品加工企業(yè)的原料供應(yīng)，對(duì)維持乳品產(chǎn)業(yè)鏈的穩(wěn)定運(yùn)行和多樣化產(chǎn)品開(kāi)發(fā)至關(guān)重要。6.營(yíng)養(yǎng)與健康：充足的牛奶供應(yīng)有助于滿足人們對(duì)高質(zhì)量蛋白質(zhì)和鈣等營(yíng)養(yǎng)素的需求，對(duì)公眾健康有著積極影響。

2、奶牛產(chǎn)奶能力的高低深受多種因素制約，而遺傳基因的作用尤為根本，優(yōu)良的遺傳特性可傳遞給后代。為了實(shí)現(xiàn)遺傳上的進(jìn)步，精心挑選高性能奶牛進(jìn)行繁殖是關(guān)鍵步驟。傳統(tǒng)育種策略，涵蓋品種登錄、乳品產(chǎn)量測(cè)定及后代性能評(píng)估等，雖發(fā)揮著基礎(chǔ)作用，但受限于世代間隔時(shí)間長(zhǎng)及進(jìn)展緩慢等問(wèn)題，難以充分適應(yīng)乳業(yè)快速發(fā)展的需求。自20世紀(jì)80年代起，隨著數(shù)學(xué)理論與計(jì)算機(jī)技術(shù)的飛躍，數(shù)量遺傳學(xué)領(lǐng)域迎來(lái)快速發(fā)展，并與分子遺傳學(xué)深度融合，催生出分子數(shù)量遺傳學(xué)這一交叉學(xué)科，引領(lǐng)動(dòng)物育種領(lǐng)域從傳統(tǒng)模式向分子層面轉(zhuǎn)型。盡管如此，傳統(tǒng)的育種實(shí)踐，如品種記錄與產(chǎn)量監(jiān)測(cè)，依然是分子育種不可或缺的基礎(chǔ)環(huán)節(jié)。在分子育種技術(shù)中，轉(zhuǎn)基因育種與基于遺傳標(biāo)記的選擇育種(mas)占據(jù)重要位置，而在提升奶牛產(chǎn)奶量的具體實(shí)踐中，mas，尤其是基因組選擇(gs)，展現(xiàn)出了廣泛應(yīng)用的前景。gs雖然沿襲了mas通過(guò)對(duì)遺傳標(biāo)記進(jìn)行選擇來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)性狀的間接選擇，卻以全基因組高密度標(biāo)記覆蓋為特點(diǎn)，極大地增強(qiáng)了育種值預(yù)測(cè)的精度。不過(guò)，基因組育種值本質(zhì)上是一種基于現(xiàn)有數(shù)據(jù)的估算，其準(zhǔn)確性受制于表型數(shù)據(jù)量、模型構(gòu)建及先驗(yàn)假設(shè)等因素。研究指出，整合那些對(duì)復(fù)雜性狀影響顯著的功能基因或遺傳標(biāo)記，能有效提升基因組選擇的精確度。因此，探索并驗(yàn)證新遺傳標(biāo)記，特別是那些與奶牛產(chǎn)奶量密切相關(guān)的標(biāo)記，成為了遺傳改良研究的核心挑戰(zhàn)之一。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明旨在揭示影響奶牛產(chǎn)奶性能的關(guān)鍵snps分子標(biāo)記，聚焦于奶?；蚪M1號(hào)染色體(nc_037328.1)的特定變異，即第141713562位點(diǎn)的t>c轉(zhuǎn)換，該位點(diǎn)位于ars-ucd1.2基因組中。通過(guò)識(shí)別并利用這些遺傳標(biāo)記，借助分子標(biāo)記輔助選擇與基因組選擇技術(shù)，選取攜帶有利基因型的奶牛進(jìn)行繁衍，旨在加速提升有益等位基因頻率，從而加速奶牛遺傳改良進(jìn)程，促進(jìn)地方奶牛養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)效益的顯著增長(zhǎng)。

2、核心目標(biāo)是鑒定與奶牛產(chǎn)奶量密切相關(guān)的snps標(biāo)記，特別關(guān)注于1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562t>c突變。所述的分子標(biāo)記的snp位點(diǎn)位于seq?id?no.4序列中的分子標(biāo)記1:g.141713562t>c，該snp在seq?id?no.4序列中的位置為5’端的第239位:

3、5’-ctggctggccatggacagcagagccagcgcagagcaaggggacggggtctgccccgcggggacctcccct?ctgagtcccactgcagggactcctcggattcacagggggctggcgacttctcagctgctggacggcttgagaaaggaag?gcgaaaagcctggcagaacctgcaggggccagcctctggggccactgctggtgagaccacttagggtagccccagggcc?tgtctctcca[t/c]gagggaatttgatgaacattcttgagtgccttcttagcagcccagagtgctggctggaaataa?aggggccagctcttcatgggtgatgacttgatagacacttgaaaggggacccaaacctttttctttcggggggtgtgta?gacagagccctgggaacatatgtgatcacccccagcattgctgggggcccccacccagggagacccgccttattctcca?gtctctctctggcctcccttgaagatggtgcaatgccccgggcccccactgaggtcttcaccccgagt-3’

4、所述snp分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.4所示，snp位于seq?id?no.4自5’端起第239位。

5、本發(fā)明的另一目的在于提供檢測(cè)上述分子標(biāo)記的引物和探針組，其特征在于，所述引物和探針組的堿基序列如下：

6、seq?id?no.1：acgttggatgctgctaagaaggcactcaag

7、seq?id?no.2：acgttggatggtgagaccacttagggtagc

8、seq?id?no.3：gggcctgtctctcca

9、本發(fā)明的另一目的在于提供檢測(cè)上述分子標(biāo)記的試劑盒，所述試劑盒包含前述引物和探針組。

10、本發(fā)明的另一目的在于提供上述的分子標(biāo)記在篩選優(yōu)良產(chǎn)奶量的奶牛個(gè)體中的應(yīng)用。具體為，檢測(cè)奶?；蚪Mars-ucd1.2基因組1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)的基因型，淘汰奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型。

11、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc或ct型的個(gè)體。

12、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型的個(gè)體。

13、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

14、本發(fā)明的另一目的在于提供一種上述kasp引物和探針組或檢測(cè)試劑盒在鑒定與奶牛產(chǎn)奶量性狀相關(guān)的位點(diǎn)基因型中的應(yīng)用。具體為，利用上述引物和探針組或試劑盒檢測(cè)奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)的基因型，淘汰上述點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型。

15、在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型或ct型的個(gè)體。

16、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，分別保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型的個(gè)體。

17、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

18、進(jìn)一步地，將上述的引物和探針組或檢測(cè)試劑盒在奶?；蚪M選擇育種中應(yīng)用。具體為，利用上述引物和探針組或試劑盒檢測(cè)奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)的基因型，淘汰上述兩位點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型。

19、在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型或ct型的個(gè)體。

20、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型的個(gè)體。

21、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

22、進(jìn)一步地，將上述的引物和探針組或檢測(cè)試劑盒在改良奶牛產(chǎn)奶量中的應(yīng)用。具體為，利用上述引物和探針組或試劑盒檢測(cè)奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)的基因型，淘汰上述位點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型。

23、在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型或ct型的個(gè)體。

24、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型的個(gè)體。

25、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

26、本發(fā)明的另一目的在于提供一種奶牛的遺傳改良的方法，所述方法包括：確定核心奶牛資源群體中的種用奶牛的上述與奶牛產(chǎn)奶量的分子標(biāo)記位點(diǎn)的基因型，并根據(jù)所述分子標(biāo)記的基因型做出相應(yīng)的選擇：在所述奶牛資源群體中淘汰奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型,逐代提高第141713562位點(diǎn)的cc型或ct型的個(gè)體基因型頻率，從而提高后代奶牛的產(chǎn)奶的產(chǎn)奶量,所述奶牛群體包括荷斯坦奶牛及其合成系。

27、在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型或ct型的個(gè)體。

28、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

29、具體包括以下步驟：

30、(1)提取待測(cè)奶牛的基因組dna；

31、(2)利用前述引物和探針組或檢測(cè)試劑盒對(duì)待測(cè)奶牛的基因型進(jìn)行檢測(cè)；

32、(3)基于檢測(cè)結(jié)果，確定所述待測(cè)奶牛在奶牛參考基因組ars-ucd1.2基因組1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)分子標(biāo)記的基因型；

33、(4)淘汰奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為tt型的個(gè)體，以淘汰劣勢(shì)基因型。

34、在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型或ct型的個(gè)體。

35、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為cc型的個(gè)體。

36、在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施例中，保留奶牛1號(hào)染色體(nc_037328.1)上第141713562位點(diǎn)為ct型的個(gè)體。

37、在優(yōu)選實(shí)施例中，上述奶牛產(chǎn)奶量。

38、在優(yōu)選實(shí)施例中，上述荷斯坦奶牛的合成系為具有荷斯坦奶牛血統(tǒng)或者遺傳背景的奶牛品系。

39、本發(fā)明相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)具有如下的優(yōu)點(diǎn)及效果：

40、第一，確定了新的與奶牛產(chǎn)奶量性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，并開(kāi)發(fā)了相應(yīng)kasp檢測(cè)引物和探針組。

41、第二，本發(fā)明確定的分子標(biāo)記應(yīng)用于奶牛產(chǎn)奶量性狀的遺傳改良中，可提高后代奶牛的產(chǎn)奶質(zhì)量，進(jìn)而增加養(yǎng)殖企業(yè)市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力。