本發(fā)明涉及三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè),具體為基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)。
背景技術(shù):
1、基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法是利用多種數(shù)據(jù)特征來預(yù)測(cè)三陰性乳腺癌患者免疫表型的方法。該方法通常集成了不同尺度的數(shù)據(jù)特征,包括基因表達(dá)數(shù)據(jù)、影像數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù),以期更準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)患者的免疫反應(yīng)情況。具體來說,該方法通過機(jī)器學(xué)習(xí)或深度學(xué)習(xí)算法,融合各類數(shù)據(jù)源的信息,提取出具有代表性的特征,并對(duì)這些特征進(jìn)行綜合分析,從而預(yù)測(cè)患者的免疫表型。這種方法能夠?yàn)閭€(gè)性化治療方案的制定提供重要的參考依據(jù),有助于提高三陰性乳腺癌患者的治療效果和生存率。
2、盡管基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法具有較高的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性和臨床應(yīng)用潛力,但該系統(tǒng)也存在一些缺陷。首先,數(shù)據(jù)獲取和整合的復(fù)雜性較高,不同數(shù)據(jù)源之間的異質(zhì)性可能導(dǎo)致數(shù)據(jù)處理和分析的難度增加,進(jìn)而影響預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性。其次,機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)算法的選擇和調(diào)參過程繁瑣,需要大量的計(jì)算資源和專業(yè)知識(shí)。此外,該系統(tǒng)在實(shí)際應(yīng)用中,可能面臨模型的泛化能力不足的問題,即在訓(xùn)練數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)良好的模型,在實(shí)際臨床應(yīng)用中可能表現(xiàn)不佳。因此,為了提高系統(tǒng)的實(shí)用性和魯棒性,仍需要進(jìn)一步優(yōu)化數(shù)據(jù)處理流程和算法模型。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、(一)解決的技術(shù)問題
2、針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足,本發(fā)明提供了基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng),解決了數(shù)據(jù)獲取和整合的復(fù)雜性較高,不同數(shù)據(jù)源之間的異質(zhì)性可能導(dǎo)致數(shù)據(jù)處理和分析的難度增加,進(jìn)而影響預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性;機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)算法的選擇和調(diào)參過程繁瑣,需要大量的計(jì)算資源和專業(yè)知識(shí)的問題。
3、(二)技術(shù)方案
4、為實(shí)現(xiàn)以上目的,本發(fā)明通過以下技術(shù)方案予以實(shí)現(xiàn):基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法,以下步驟:
5、s1、數(shù)據(jù)采集:從患者中獲取基因表達(dá)數(shù)據(jù)、影像數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù);
6、s2、數(shù)據(jù)預(yù)處理:對(duì)采集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化和歸一化處理,以減少數(shù)據(jù)間的異質(zhì)性,標(biāo)準(zhǔn)化公式:
7、
8、其中,x是原始數(shù)據(jù),μ是均值,σ是標(biāo)準(zhǔn)差,歸一化公式:
9、
10、其中,min(x)和)max(x)分別是數(shù)據(jù)的最小值和最大值,
11、s3、特征提?。簭念A(yù)處理后的數(shù)據(jù)中提取多尺度特征,包括基因特征、影像特征和臨床特征,卷積操作公式:
12、conv0=(①*+b)
13、s4、數(shù)據(jù)融合:采用數(shù)據(jù)融合技術(shù)將多尺度特征進(jìn)行整合,形成綜合特征向量,主成分分析公式:
14、zxw
15、其中,x是原始數(shù)據(jù)矩陣,w是主成分載荷矩陣,z是主成分得分矩陣,特征選擇:應(yīng)用特征選擇算法,從綜合特征向量中篩選出與免疫表型高度相關(guān)的特征,隨機(jī)森林算法公式:
16、
17、其中,y是預(yù)測(cè)結(jié)果,f(x)是隨機(jī)森林模型,h?i(x)是第i棵決策樹n是決策樹的數(shù)量;
18、s5、模型構(gòu)建:基于篩選后的特征,采用機(jī)器學(xué)習(xí)或深度學(xué)習(xí)算法構(gòu)建預(yù)測(cè)模型,多層感知器公式:
19、
20、其中,y^是輸出,σ是激活函數(shù),w1和w2是權(quán)重矩陣,b1和b2是偏置項(xiàng);
21、s6、模型訓(xùn)練:利用訓(xùn)練數(shù)據(jù)集對(duì)預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,優(yōu)化模型參數(shù),交叉驗(yàn)證公式:
22、
23、其中,f是模型,x和y分別是數(shù)據(jù)和標(biāo)簽,k是折數(shù);
24、s7、模型驗(yàn)證:利用驗(yàn)證數(shù)據(jù)集對(duì)訓(xùn)練好的模型進(jìn)行驗(yàn)證,評(píng)估模型的性能;
25、
26、其中,tpr是真陽性率,fpr是假陽性率,t是閾值;
27、s8、模型調(diào)優(yōu):根據(jù)驗(yàn)證結(jié)果對(duì)模型進(jìn)行調(diào)優(yōu),以提高預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性,網(wǎng)格搜索公式:
28、
29、其中,θ是參數(shù),θ是參數(shù)空間,l是損失函數(shù),fθ是模型,x?i和y?i分別是數(shù)據(jù)和標(biāo)簽,n是數(shù)據(jù)數(shù)量;
30、s9、模型測(cè)試:利用獨(dú)立的測(cè)試數(shù)據(jù)集對(duì)調(diào)優(yōu)后的模型進(jìn)行測(cè)試,評(píng)估模型的泛化能力,混淆矩陣公式:
31、
32、其中,tp是真陽性,fp是假陽性,fn是假陰性,tn是真陰性,f1-score公式:
33、
34、其中,prec?i?s?i?on為精確率,reca?l?l為召回率;
35、s10、結(jié)果輸出:將測(cè)試結(jié)果輸出為患者的免疫表型預(yù)測(cè)結(jié)果,綜合評(píng)分公式:
36、
37、其中,wi是權(quán)重,f?i(x)是特征評(píng)分,n是特征數(shù)量;
38、s11、臨床應(yīng)用:根據(jù)預(yù)測(cè)結(jié)果制定個(gè)性化治療方案,輔助臨床決策,個(gè)性化治療方案公式:
39、
40、其中,t是治療方案,t是治療方案集合,x是患者數(shù)據(jù),e是期望值,outcomeoutcome是治療效果。
41、優(yōu)選的,所述數(shù)據(jù)采集步驟包括從公開數(shù)據(jù)庫和醫(yī)院內(nèi)部數(shù)據(jù)庫獲取數(shù)據(jù),所述數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟包括缺失值填補(bǔ)、數(shù)據(jù)平滑和降噪處理。
42、優(yōu)選的,所述特征提取步驟采用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行影像特征提取,所述數(shù)據(jù)融合步驟采用主成分分析技術(shù)進(jìn)行特征融合。
43、優(yōu)選的,所述特征選擇步驟采用隨機(jī)森林算法進(jìn)行特征篩選,所述模型構(gòu)建步驟采用多層感知器進(jìn)行預(yù)測(cè)模型的構(gòu)建。
44、優(yōu)選的,所述模型訓(xùn)練步驟采用交叉驗(yàn)證技術(shù)進(jìn)行模型訓(xùn)練,所述模型驗(yàn)證步驟采用roc曲線和auc值進(jìn)行性能評(píng)估,所述模型調(diào)優(yōu)步驟采用網(wǎng)格搜索算法進(jìn)行參數(shù)調(diào)優(yōu)。
45、優(yōu)選的,所述模型測(cè)試步驟采用混淆矩陣和f1-score進(jìn)行評(píng)估,所述結(jié)果輸出步驟包括生成詳細(xì)的預(yù)測(cè)報(bào)告供醫(yī)生參考。
46、優(yōu)選的,所述臨床應(yīng)用步驟包括周期性地更新模型,以確保模型性能隨時(shí)間變化而優(yōu)化,所述數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟還包括數(shù)據(jù)增強(qiáng)處理,以增加訓(xùn)練數(shù)據(jù)的多樣性。
47、優(yōu)選的,數(shù)據(jù)采集模塊、特征學(xué)習(xí)模塊、預(yù)處理模塊、特征提取模塊、數(shù)據(jù)融合模塊。
48、(三)有益效果
49、本發(fā)明提供了基于多尺度特征的三陰性乳腺癌免疫表型預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)。具備以下有益效果:
50、通過整合多種數(shù)據(jù)源的信息,減少了單一數(shù)據(jù)源帶來的偏差,提高了預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性和可靠性,數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟中的標(biāo)準(zhǔn)化和歸一化處理,以及缺失值填補(bǔ)、數(shù)據(jù)平滑和降噪處理,減少了數(shù)據(jù)間的異質(zhì)性,使數(shù)據(jù)更具一致性,特征提取過程中采用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行影像特征提取,主成分分析技術(shù)進(jìn)行數(shù)據(jù)融合,隨機(jī)森林算法進(jìn)行特征篩選,多層感知器進(jìn)行模型構(gòu)建,確保了模型的先進(jìn)性和有效性,模型訓(xùn)練和驗(yàn)證過程中采用交叉驗(yàn)證技術(shù)、roc曲線和auc值進(jìn)行性能評(píng)估,以及網(wǎng)格搜索算法進(jìn)行參數(shù)調(diào)優(yōu),提高了模型的泛化能力和適用性,模型測(cè)試采用混淆矩陣和f1-score進(jìn)行評(píng)估,結(jié)果輸出包括生成詳細(xì)的預(yù)測(cè)報(bào)告,為醫(yī)生提供了可靠的決策依據(jù),臨床應(yīng)用中,通過周期性地更新模型,保持模型性能的持續(xù)優(yōu)化,確保模型在實(shí)際應(yīng)用中的穩(wěn)定性和有效性,數(shù)據(jù)增強(qiáng)處理增加了訓(xùn)練數(shù)據(jù)的多樣性,進(jìn)一步提高了模型的魯棒性和適應(yīng)性。